Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms