Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clip2Q9Z0H8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip2Q9Z0H8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip2Q9Z0H8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms