Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin2Q9WVE8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin2Q9WVE8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin2Q9WVE8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacsin2Q9WVE8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacsin2Q9WVE8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacsin2Q9WVE8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacsin2Q9WVE8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin2Q9WVE8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pacsin2Q9WVE8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms