Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lhx9Q9WUH2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lhx9Q9WUH2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx9Q9WUH2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms