Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcsQ9WU84 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CcsQ9WU84 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms