Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spo11Q9WTK8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spo11Q9WTK8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spo11Q9WTK8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms