Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sorbs3Q9R1Z8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sorbs3Q9R1Z8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sorbs3Q9R1Z8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms