Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11cQ9QZW0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11cQ9QZW0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms