Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tspan3Q9QY33 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan3Q9QY33 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan3Q9QY33 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms