Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn4Q9QXZ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn4Q9QXZ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Opn4Q9QXZ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms