Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdcQ9QW08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdcQ9QW08 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms