Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms