Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms