Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn6Q9JMB8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn6Q9JMB8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn6Q9JMB8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn6Q9JMB8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntn6Q9JMB8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntn6Q9JMB8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn6Q9JMB8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn6Q9JMB8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn6Q9JMB8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms