Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA2

Qtrt1, Queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qtrt1Q9JMA2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Qtrt1Q9JMA2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Qtrt1Q9JMA2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Qtrt1Q9JMA2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms