Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtsmQ9JL96 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsmQ9JL96 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms