Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cnot9Q9JKY0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms