Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole3Q9JKP7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole3Q9JKP7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms