Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms