Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng4Q9JJV4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms