Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 345.9 ms