Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem47Q9JJG6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem47Q9JJG6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem47Q9JJG6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem47Q9JJG6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms