Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc86Q9JJ89 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc86Q9JJ89 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms