Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmbr1Q9JIT0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmbr1Q9JIT0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmbr1Q9JIT0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms