Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppp1r3fQ9JIG4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms