Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EefsecQ9JHW4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 394.8 ms