Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESL0

Oxct2b, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2bQ9ESL0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Oxct2bQ9ESL0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Oxct2bQ9ESL0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Oxct2bQ9ESL0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Oxct2bQ9ESL0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Oxct2bQ9ESL0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Oxct2bQ9ESL0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Oxct2bQ9ESL0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Oxct2bQ9ESL0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Oxct2bQ9ESL0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Oxct2bQ9ESL0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms