Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Rb1cc1Q9ESK9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC40.04■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms