Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp3a44Q9EQW4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp3a44Q9EQW4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms