Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
V1ra8Q9EQ48 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms