Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr6Q9EQ16 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcr6Q9EQ16 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcr6Q9EQ16 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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