Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms