Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Riok3Q9DBU3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Riok3Q9DBU3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms