Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Asf1bQ9DAP7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Asf1bQ9DAP7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms