Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snx5Q9D8U8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx5Q9D8U8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx5Q9D8U8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms