Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tvp23bQ9D8T4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms