Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jam3Q9D8B7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jam3Q9D8B7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jam3Q9D8B7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jam3Q9D8B7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jam3Q9D8B7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jam3Q9D8B7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Jam3Q9D8B7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jam3Q9D8B7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jam3Q9D8B7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms