Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2af1Q9D883 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
U2af1Q9D883 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2af1Q9D883 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms