Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
2310002L09RikQ9D7L5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
2310002L09RikQ9D7L5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2310002L09RikQ9D7L5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms