Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb8Q9D6J5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb8Q9D6J5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb8Q9D6J5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms