Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc2hc1bQ9D534 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms