Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam90a1bQ9D4F3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam90a1bQ9D4F3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam90a1bQ9D4F3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms