Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy3Q9D394 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms