Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hddc3Q9D114 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hddc3Q9D114 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hddc3Q9D114 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms