Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Elp3Q9CZX0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Elp3Q9CZX0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Elp3Q9CZX0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms