Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
3100002H09RikQ9CXW6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
3100002H09RikQ9CXW6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms