Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ska2Q9CR46 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ska2Q9CR46 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms