Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifitm3Q9CQW9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifitm3Q9CQW9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms