Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms