Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed6Q9CQG0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms