Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpa3Q9CQ71 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms